Muzeum Wilna od razu stało się popularne wśród mieszkańców i gości stolicy. Nie ma tu stałej ekspozycji, ale organizowane wystawy czasowe cieszą się dużym zainteresowaniem. Prezentują dzieje Wilna w sposób współczesny i atrakcyjny, przypominają zapomniane okresy z historii, pomagają też w zrozumieniu dzisiejszego miasta.